Protein–RNA interactions for Protein: Q12309

CLF1, Pre-mRNA-splicing factor CLF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CLF1Q12309 NAT2YGR147C 867 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YGR149WYGR149W 1299 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 NKP2YLR315W 462 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YMR085WYMR085W 1299 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 ATP20YPR020W 348 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 OM14YBR230C 405 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 PUT2YHR037W 1728 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 LYS2YBR115C 4179 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SWC3YAL011W 1878 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 IOC4YMR044W 1428 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 MIH1YMR036C 1665 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 OSH2YDL019C 3852 nt4.96□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YER158CYER158C 1722 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YML020WYML020W 1995 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 RRP8YDR083W 1179 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 RFA3YJL173C 369 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 CDC8YJR057W 651 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 CNB1YKL190W 528 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YRA2YKL214C 612 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 FMP46YKR049C 402 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 VMA6YLR447C 1038 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 COG5YNL051W 1212 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SPO19YPL130W 672 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 POP4YBR257W 840 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 GCR1YPL075W 2358 nt4.95□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 PRP31YGR091W 1485 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SHE9YDR393W 1371 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 OCA4YCR095C 1089 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YFR057WYFR057W 456 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tL(UAG)JtL(UAG)J 82 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tL(UAG)L1tL(UAG)L1 82 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 tL(UAG)L2tL(UAG)L2 82 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 NSE1YLR007W 1011 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 MFM1YPL060W 1242 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 ART10YLR392C 1557 nt4.94□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 snR7-SsnR7-S 179 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YDR042CYDR042C 603 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 RPC25YKL144C 639 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YKR070WYKR070W 1059 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SMD2YLR275W 333 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 CPR3YML078W 549 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SHE1YBL031W 1017 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 HUA2YOR284W 732 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 CBP3YPL215W 1008 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 ARX1YDR101C 1782 nt4.93□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 RKM3YBR030W 1659 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YPL260WYPL260W 1656 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 EGT2YNL327W 3126 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YMR221CYMR221C 1515 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 PHM7YOL084W 2976 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 TRM1YDR120C 1713 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 PDR5YOR153W 4536 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 snR7-LsnR7-L 214 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 CWC23YGL128C 852 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SDS3YIL084C 984 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 USB1YLR132C 873 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 RIF2YLR453C 1188 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 RPS1BYML063W 768 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YNL050CYNL050C 813 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YBL068W-AYBL068W-A 237 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YBL096CYBL096C 309 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SPN1YPR133C 1233 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SHE3YBR130C 1278 nt4.92□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 IMA3YIL172C 1770 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 IMA4YJL221C 1770 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YEL045CYEL045C 426 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 STE2YFL026W 1296 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YGL188CYGL188C 174 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 PEF1YGR058W 1008 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 KTR2YKR061W 1278 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 AIM39YOL053W 1188 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 SAS5YOR213C 747 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 POC4YPL144W 447 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YCL001W-AYCL001W-A 462 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 RRP7YCL031C 894 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 DIT2YDR402C 1470 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 ZPR1YGR211W 1461 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 BOP2YLR267W 1713 nt4.91□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 GRC3YLL035W 1899 nt4.9□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 MDM38YOL027C 1722 nt4.9□□□□□ -1.62
CLF1Q12309 YGL230CYGL230C 444 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YGR111WYGR111W 1203 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 GPN3YLR243W 819 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 RPL15BYMR121C 615 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 ERD2YBL040C 660 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 ATG8YBL078C 354 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YNL320WYNL320W 855 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 FDH1YOR388C 1131 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 CDC6YJL194W 1542 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 PHO84YML123C 1764 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 PUF2YPR042C 3228 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 KAP114YGL241W 3015 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 YSH1YLR277C 2340 nt4.9□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 MCP2YLR253W 1710 nt4.89□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 TFB3YDR460W 966 nt4.89□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 Q0142Q0142 177 nt4.89□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 BTN2YGR142W 1233 nt4.89□□□□□ -1.63
CLF1Q12309 PSF2YJL072C 642 nt4.89□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.6 ms