Protein–RNA interactions for Protein: Q12193

TY1B-BR, Transposon Ty1-BR Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Predictions only

Length 1,756 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-BRQ12193 AFT1YGL071W 2073 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 SPO16YHR153C 597 nt4.48□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YDR186CYDR186C 2634 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 FKH1YIL131C 1455 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YKR070WYKR070W 1059 nt4.47□□□□□ -1.69
TY1B-BRQ12193 YOR022CYOR022C 2148 nt4.46□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 SPT6YGR116W 4356 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 HOS1YPR068C 1413 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 RPS11AYDR025W 471 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 SRP40YKR092C 1221 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 ATG3YNR007C 933 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 YPL168WYPL168W 1293 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 CBP3YPL215W 1008 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 VAC7YNL054W 3498 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 CDC14YFR028C 1656 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 snR70snR70 164 nt4.45□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 AYT1YLL063C 1425 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 SAC1YKL212W 1872 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 ARP4YJL081C 1470 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 CAJ1YER048C 1176 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 ICY1YMR195W 384 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 TFB2YPL122C 1542 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 ATG2YNL242W 4779 nt4.44□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 UBP1YDL122W 2430 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 ENA5YDR038C 3276 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 PAM18YLR008C 507 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 WTM2YOR229W 1404 nt4.43□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 PEF1YGR058W 1008 nt4.42□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 TOM7YNL070W 183 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 TFB4YPR056W 1017 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 GPI18YBR004C 1302 nt4.41□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 ESL2YKR096W 3588 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 RPS13YDR064W 456 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 SEC17YBL050W 879 nt4.4□□□□□ -1.7
TY1B-BRQ12193 HEF3YNL014W 3135 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 PRP22YER013W 3438 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 SAW1YAL027W 786 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 SHH3YMR118C 591 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 CHS2YBR038W 2892 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YBR298C-AYBR298C-A 222 nt4.4□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 TSC11YER093C 4293 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 KTR7YIL085C 1554 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 BCP1YDR361C 852 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 ARP1YHR129C 1155 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YPR050CYPR050C 414 nt4.39□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 RAX2YLR084C 3663 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YGR079WYGR079W 1113 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 KTI11YBL071W-A 249 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 UGA3YDL170W 1587 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 RBA50YDR527W 1320 nt4.38□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YGR016WYGR016W 573 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 IDP2YLR174W 1239 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 OM14YBR230C 405 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YDR537CYDR537C 606 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YMR294W-AYMR294W-A 360 nt4.37□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 MDM34YGL219C 1380 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 SPP41YDR464W 4308 nt4.36□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 TRM44YPL030W 1704 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 PTP3YER075C 2787 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 CLB3YDL155W 1284 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YGR122WYGR122W 1209 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 CIN8YEL061C 3003 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 MPC54YOR177C 1395 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 BUD5YCR038C 1929 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 PEX1YKL197C 3132 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 RPL23AYBL087C 414 nt4.35□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 RPA135YPR010C 3612 nt4.34□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 ATG27YJL178C 816 nt4.34□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 YCL023CYCL023C 348 nt4.34□□□□□ -1.71
TY1B-BRQ12193 NEW1YPL226W 3591 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 UBC1YDR177W 648 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 LSM12YHR121W 564 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YMR315WYMR315W 1050 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YOL019WYOL019W 1656 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 VPS17YOR132W 1656 nt4.33□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 STE11YLR362W 2154 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 PSF1YDR013W 627 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 CNL1YDR357C 369 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YFR032C-BYFR032C-B 264 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YHL005CYHL005C 393 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YAP5YIR018W 738 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YNL108CYNL108C 813 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 SMF1YOL122C 1728 nt4.32□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 CIT3YPR001W 1461 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YHR078WYHR078W 1659 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 SEC9YGR009C 1956 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 TUL1YKL034W 2277 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 PRR2YDL214C 2100 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YLR278CYLR278C 4026 nt4.31□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 SLD2YKL108W 1362 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YDR222WYDR222W 1248 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 JIP3YLR331C 378 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 OSW7YFR039C 1533 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YPR003CYPR003C 2265 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 SAP155YFR040W 3009 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 EMC6YLL014W 327 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 YLR346CYLR346C 306 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 CUZ1YNL155W 825 nt4.3□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 TRS85YDR108W 2097 nt4.29□□□□□ -1.72
TY1B-BRQ12193 SNF3YDL194W 2655 nt4.29□□□□□ -1.72
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