Protein–RNA interactions for Protein: Q12071

VPS54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, yeastyeast

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Length 889 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VPS54Q12071 YHR112CYHR112C 1137 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 PAM18YLR008C 507 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 HTA2YBL003C 399 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YGK3YOL128C 1128 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 MRPL37YBR268W 318 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 PIM1YBL022C 3402 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SPB4YFL002C 1821 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 TCO89YPL180W 2400 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SSH1YBR283C 1473 nt4.11□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SRO7YPR032W 3102 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YDR133CYDR133C 336 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SPO73YER046W 432 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CLC1YGR167W 702 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SIW14YNL032W 846 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 MCK1YNL307C 1128 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 GPI2YPL076W 843 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YBR255C-AYBR255C-A 363 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 BUD5YCR038C 1929 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 SPS2YDR522C 1509 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YLR345WYLR345W 1530 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 TDA3YHR009C 1572 nt4.1□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CNN1YFR046C 1086 nt4.09□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YGR149WYGR149W 1299 nt4.09□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 HIS5YIL116W 1158 nt4.09□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 YSA1YBR111C 696 nt4.09□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 BMT2YBR141C 1014 nt4.09□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CHL1YPL008W 2586 nt4.09□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 ALO1YML086C 1581 nt4.09□□□□□ -1.75
VPS54Q12071 CTR86YCR054C 1692 nt4.09□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YCF1YDR135C 4548 nt4.09□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 DBP3YGL078C 1572 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 COS8YHL048W 1146 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 ARC15YIL062C 465 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 AIM21YIR003W 2040 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 TAF8YML114C 1533 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 SHE1YBL031W 1017 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YBL094CYBL094C 333 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 FRM2YCL026C-A 582 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 GAL11YOL051W 3246 nt4.08□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 LTV1YKL143W 1392 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 VAC17YCL063W 1272 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 ATP5YDR298C 639 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 POP6YGR030C 477 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 FMC1YIL098C 468 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 RPC17YJL011C 486 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YKL162C-AYKL162C-A 153 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 FOL3YMR113W 1284 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 NDJ1YOL104C 1059 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 DIP2YLR129W 2832 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 GCD1YOR260W 1737 nt4.07□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 ROK1YGL171W 1695 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 FAS2YPL231W 5664 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 VMA1YDL185W 3216 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YBR225WYBR225W 2703 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 CWC2YDL209C 1020 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YDR222WYDR222W 1248 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YDR230WYDR230W 348 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YUH1YJR099W 711 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 TFA2YKR062W 987 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YLR428CYLR428C 345 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 SPO20YMR017W 1194 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 USA1YML029W 2517 nt4.06□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 MGR3YMR115W 1506 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 ROD1YOR018W 2514 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 BIK1YCL029C 1323 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 MAG1YER142C 891 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YGL152CYGL152C 678 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 AIM22YJL046W 1230 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 BAT2YJR148W 1131 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 FLD1YLR404W 858 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YBL036CYBL036C 774 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 PWR1PWR1 941 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 CLN2YPL256C 1638 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 ACE2YLR131C 2313 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 MSA1YOR066W 1890 nt4.05□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 NCR1YPL006W 3513 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 PPQ1YPL179W 1650 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 SRP72YPL210C 1923 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YCL076WYCL076W 744 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 SEM1YDR363W-A 270 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YHR173CYHR173C 339 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 BNA1YJR025C 534 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YJR096WYJR096W 849 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YLR363W-AYLR363W-A 258 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YNL144W-AYNL144W-A 84 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 IAH1YOR126C 717 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 ATG2YNL242W 4779 nt4.04□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 CPR1YDR155C 489 nt4.03□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 HSP42YDR171W 1128 nt4.03□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 IRC9YJL142C 393 nt4.03□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 DID4YKL002W 699 nt4.03□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 YPL162CYPL162C 822 nt4.03□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 GRX1YCL035C 333 nt4.03□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 VPS45YGL095C 1734 nt4.03□□□□□ -1.76
VPS54Q12071 URC2YDR520C 2319 nt4.03□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 CTK1YKL139W 1587 nt4.02□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 MSW1YDR268W 1140 nt4.02□□□□□ -1.77
VPS54Q12071 YEL074WYEL074W 339 nt4.02□□□□□ -1.77
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