Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCBP1Q09161 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NCBP1Q09161 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NCBP1Q09161 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms