Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC35.7■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC35.7■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC35.7■■■■□ 3.31
GOLGA3Q08378 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.7■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.7■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC35.68■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.68■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC35.68■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC35.67■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.66■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.66■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
GOLGA3Q08378 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC35.63■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.62■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.61■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC35.58■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.29
GOLGA3Q08378 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC35.57■■■■□ 3.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms