Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FOXM1Q08050 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FOXM1Q08050 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FOXM1Q08050 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms