Protein–RNA interactions for Protein: Q03721

KCNC4, Potassium voltage-gated channel subfamily C member 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNC4Q03721 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
KCNC4Q03721 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
KCNC4Q03721 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms