Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC38.09■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.09■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC38.09■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC38.08■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC38.08■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.69
ERCC6Q03468 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.07■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.06■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC38.06■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC38.06■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC38.05■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC38.05■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38.05■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC38.04■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC38.04■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC38.04■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC38.03■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.02■■■■□ 3.68
ERCC6Q03468 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.01■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC38■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC37.99■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC37.97■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC37.97■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
ERCC6Q03468 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.97■■■■□ 3.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms