Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BNC1Q01954 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
BNC1Q01954 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms