Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SPTBN1Q01082 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SPTBN1Q01082 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms