Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
BEX3Q00994 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
BEX3Q00994 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
BEX3Q00994 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms