Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CLTCQ00610 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLTCQ00610 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC32.2■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLTCQ00610 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms