Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FANCCQ00597 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FANCCQ00597 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms