Protein–RNA interactions for Protein: P98196

ATP11A, Probable phospholipid-transporting ATPase IH, humanhuman

Predictions only

Length 1,134 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP11AP98196 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ATP11AP98196 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
ATP11AP98196 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ATP11AP98196 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms