Protein–RNA interactions for Protein: P78348

ASIC1, Acid-sensing ion channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASIC1P78348 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ASIC1P78348 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ASIC1P78348 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms