Protein–RNA interactions for Protein: P67936

TPM4, Tropomyosin alpha-4 chain, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM4P67936 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TPM4P67936 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TPM4P67936 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TPM4P67936 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TPM4P67936 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TPM4P67936 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM4P67936 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM4P67936 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM4P67936 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM4P67936 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM4P67936 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM4P67936 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TPM4P67936 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TPM4P67936 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TPM4P67936 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TPM4P67936 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TPM4P67936 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TPM4P67936 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TPM4P67936 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms