Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ACTG1P63261 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ACTG1P63261 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms