Protein–RNA interactions for Protein: P62745

RHOB, Rho-related GTP-binding protein RhoB, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOBP62745 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RHOBP62745 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOBP62745 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOBP62745 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
RHOBP62745 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RHOBP62745 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RHOBP62745 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
RHOBP62745 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
RHOBP62745 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms