Protein–RNA interactions for Protein: P61587

RND3, Rho-related GTP-binding protein RhoE, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND3P61587 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RND3P61587 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RND3P61587 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RND3P61587 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RND3P61587 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RND3P61587 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RND3P61587 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RND3P61587 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RND3P61587 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RND3P61587 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
RND3P61587 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RND3P61587 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RND3P61587 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RND3P61587 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RND3P61587 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RND3P61587 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms