Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HERVK_113P61574 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
HERVK_113P61574 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms