Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERVK11-1P61568 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ERVK11-1P61568 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms