Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ERVFC1-1P60608 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
ERVFC1-1P60608 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms