Protein–RNA interactions for Protein: P60508

ERVFRD-1, Syncytin-2, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFRD-1P60508 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
ERVFRD-1P60508 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ERVFRD-1P60508 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms