Protein–RNA interactions for Protein: P58215

LOXL3, Lysyl oxidase homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL3P58215 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LOXL3P58215 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LOXL3P58215 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms