Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME5P56597 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME5P56597 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
NME5P56597 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NME5P56597 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NME5P56597 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
NME5P56597 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
NME5P56597 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
NME5P56597 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
NME5P56597 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NME5P56597 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
NME5P56597 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
NME5P56597 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms