Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HDAC4P56524 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HDAC4P56524 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms