Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC13P55735 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC13P55735 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SEC13P55735 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SEC13P55735 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SEC13P55735 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SEC13P55735 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SEC13P55735 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC13P55735 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC13P55735 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC13P55735 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC13P55735 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SEC13P55735 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SEC13P55735 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
SEC13P55735 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms