Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTPN5P54829 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTPN5P54829 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms