Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CACNB3P54284 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CACNB3P54284 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CACNB3P54284 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms