Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PMS2P54278 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PMS2P54278 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
PMS2P54278 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PMS2P54278 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PMS2P54278 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P54278 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P54278 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P54278 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P54278 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P54278 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PMS2P54278 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PMS2P54278 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PMS2P54278 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PMS2P54278 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PMS2P54278 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms