Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
AP3M2P53677 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
AP3M2P53677 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms