Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
LIMK2P53671 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
LIMK2P53671 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms