Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ARFIP2P53365 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ARFIP2P53365 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms