Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CCR4P51679 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCR4P51679 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCR4P51679 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCR4P51679 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCR4P51679 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCR4P51679 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCR4P51679 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCR4P51679 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCR4P51679 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCR4P51679 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CCR4P51679 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms