Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
DAP3P51398 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
DAP3P51398 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
DAP3P51398 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
DAP3P51398 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
DAP3P51398 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms