Protein–RNA interactions for Protein: P51168

SCNN1B, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCNN1BP51168 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SCNN1BP51168 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SCNN1BP51168 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms