Protein–RNA interactions for Protein: P50990

CCT8, T-complex protein 1 subunit theta, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT8P50990 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT8P50990 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT8P50990 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT8P50990 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT8P50990 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CCT8P50990 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCT8P50990 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCT8P50990 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCT8P50990 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8P50990 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCT8P50990 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8P50990 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8P50990 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCT8P50990 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms