Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GATMP50440 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GATMP50440 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATMP50440 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATMP50440 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATMP50440 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATMP50440 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
GATMP50440 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATMP50440 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GATMP50440 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATMP50440 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATMP50440 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATMP50440 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GATMP50440 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GATMP50440 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GATMP50440 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GATMP50440 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GATMP50440 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GATMP50440 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GATMP50440 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms