Protein–RNA interactions for Protein: P49810

PSEN2, Presenilin-2, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN2P49810 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PSEN2P49810 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PSEN2P49810 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PSEN2P49810 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms