Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CLK1P49759 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CLK1P49759 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLK1P49759 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLK1P49759 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CLK1P49759 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLK1P49759 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLK1P49759 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CLK1P49759 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLK1P49759 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CLK1P49759 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CLK1P49759 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
CLK1P49759 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
CLK1P49759 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms