Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
NUMBP49757 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
NUMBP49757 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
NUMBP49757 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
NUMBP49757 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
NUMBP49757 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
NUMBP49757 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
NUMBP49757 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NUMBP49757 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NUMBP49757 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms