Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CSNK1EP49674 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CSNK1EP49674 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms