Protein–RNA interactions for Protein: P49590

HARS2, Probable histidine--tRNA ligase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HARS2P49590 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HARS2P49590 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HARS2P49590 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HARS2P49590 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HARS2P49590 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HARS2P49590 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HARS2P49590 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HARS2P49590 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HARS2P49590 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HARS2P49590 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HARS2P49590 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HARS2P49590 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms