Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX1P48742 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX1P48742 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX1P48742 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX1P48742 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LHX1P48742 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LHX1P48742 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LHX1P48742 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LHX1P48742 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LHX1P48742 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX1P48742 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX1P48742 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LHX1P48742 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX1P48742 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX1P48742 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX1P48742 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX1P48742 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LHX1P48742 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LHX1P48742 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LHX1P48742 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX1P48742 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX1P48742 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX1P48742 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX1P48742 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LHX1P48742 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LHX1P48742 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms