Protein–RNA interactions for Protein: P48556

PSMD8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD8P48556 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PSMD8P48556 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PSMD8P48556 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms