Protein–RNA interactions for Protein: P47804

RGR, RPE-retinal G protein-coupled receptor, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGRP47804 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
RGRP47804 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RGRP47804 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RGRP47804 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RGRP47804 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RGRP47804 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGRP47804 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGRP47804 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGRP47804 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RGRP47804 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RGRP47804 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RGRP47804 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RGRP47804 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGRP47804 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGRP47804 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RGRP47804 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms