Protein–RNA interactions for Protein: P43657

LPAR6, Lysophosphatidic acid receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPAR6P43657 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LPAR6P43657 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LPAR6P43657 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms