Protein–RNA interactions for Protein: P42858

HTT, Huntingtin, humanhuman

Predictions only

Length 3,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTTP42858 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTTP42858 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTTP42858 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HTTP42858 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HTTP42858 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTTP42858 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTTP42858 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HTTP42858 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTTP42858 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTTP42858 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTTP42858 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HTTP42858 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HTTP42858 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HTTP42858 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTTP42858 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTTP42858 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTTP42858 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTTP42858 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTTP42858 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTTP42858 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HTTP42858 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HTTP42858 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HTTP42858 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTTP42858 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HTTP42858 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTTP42858 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTTP42858 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HTTP42858 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HTTP42858 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTTP42858 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTTP42858 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTTP42858 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HTTP42858 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
HTTP42858 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HTTP42858 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms