Protein–RNA interactions for Protein: P42263

GRIA3, Glutamate receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA3P42263 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GRIA3P42263 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GRIA3P42263 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms