Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ARL1P40616 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ARL1P40616 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ARL1P40616 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms